舟曲林业局隶属白龙江林业管理局，舟曲林业局前身为两水森工局，1952年由西北军政委员会农林部筹建于甘肃省武都县，1958年开始进行森工生产，1971年由武都县两水镇迁至舟曲县城，更名为舟曲林业局。