牡丹区吴店镇是2000年经山东省人民政府批准成立的中心镇，北邻小留镇，南依城区，东接高庄镇，西邻黄堽镇，辖38个行政村，一个社区，88个自然村，总面积58.3平方公里，现有人口5.4万人，耕地5.2万亩。区位优越，交通便利。吴店镇位于菏泽市牡丹区城乡结合部，镇机关驻地跟日东高速公路入口处2公里，距区委、区政府7公里。省道菏刘路、临商路纵贯南北，日（日照）东（东明）高速公路横穿东西，境内设有西出入口，水、电、路、讯等基础设施日臻完善。