通州监狱始建于1951年8月，称“南通劳改支队”，隶属于南通地区专员公署公安处。下设2个大队，一大队在南通市从事手工织布（即现南通监狱前身）、二大队在“环本荡”种田，支队部设在“环本荡”。 1969年2月，整建制划给军垦，改称“中国人民解放军南京军区江苏省生产建设兵团第四师第二十二团”，在押犯和留场人员同时全部撤走。 1975年，兵团撤销，转为农垦，隶属江苏省农垦局。 1984年1月，为适应“严打”形势需要，恢复劳改建制，称“江苏省第二十一劳动改造管教支队”，隶属于南通市人民政府，1986年11月变更隶属关系，划归省劳改工作局。1994年12月更名为“江苏省通州监狱”。