新干县国土资源局位于县城川南东路2号。

内设8个职能股室，分别为办公室（人事教育股）、土地利用股（耕地保护股）、地籍管理股、测绘地理信息股、地质矿产股、法规股（信访办公室）、行政服务股、监察室；

下设2个副科事业单位和3个正股级事业单位，分别为：新干县土地矿产储备交易中心和新干县国土资源局执法监察大队等2个副科事业单位，以及新干县土地整理中心、新干县国土资源局信息中心、新干县地质灾害应急中心等3个正股级事业单位；新干县工业园区国土资源所和13个乡镇国土资源所为新干县国土资源局派出的股级事业单位。