巴藏沟回族乡位于青海省平安县东部的巴藏沟，地处县境东南部，距县府驻地17千米。东邻乐都县下营乡，西接沙沟回族乡政府，南靠花石岩山与化隆县接壤，北连平安镇东庄村。