马群科技园位于南京主城城中，沪宁高速入口，地处“紫金山—灵山—龙王山”生态廊道，环境优越，交通便利。309、139、163等12条公交线、地铁2号线以及正在建的地铁4号线及地铁换乘枢纽，将科技园与主城区紧密相连。沪宁高速、宁杭公路、绕城公路在此交汇，宁芜铁路、京沪高铁贯穿其中，到中山门仅要6分钟，到禄口国际机场只需半小时，向北15分钟可至国内最大的内河外贸港——龙潭港，从紫金山站乘高铁1个多小时可直达上海。