墨玉县萨依巴格乡位于县城西南部，乡政府驻地距县城21千米，东北部与阿克萨拉依乡相连；北部与扎瓦镇接壤；西部深入苏格塞戈壁腹地与皮山县的杜瓦镇相邻；东隔喀拉喀什河与和田县相望；南连昆仑山与和田县为界；境南有乌鲁瓦提山。地域为东径7936′～7943′，北纬3652′～3708′，海拔高度1345米～3663米，地形自南向北倾斜，南北狭长，坡降较大。土地面积2227平方千米，耕地面积33399亩，人均占有耕地1.14亩。