十三陵镇位于北京市昌平区西北部，距北京市区35公里，镇域面积158.8平方公里。镇域北邻北京市延庆区，西与南口镇相邻，南靠昌平老城区和城南街道邓庄村，东接延寿镇、崔村镇和南邵镇。

十三陵镇现有镇域是在原十三陵镇和原长陵镇镇域的基础上于2011年8月通过区划调整形成。镇名因世界文化遗产明十三陵坐落于此地而得名。