柯克亚乡位于叶城县城西南219国道62公里处，全乡总面积3662.5平方公里。共下辖17个行政村、54个村民小组，3571户，总人口17827人。居住着维吾尔族和塔吉克族两个民族，全乡耕地总面积为11984亩，人均占有0.71亩。由于柯克亚乡地处山区，各村相对疏远分散，故分为四个片区进行管理，即柯克亚片区、西合甫片区、莫木克片区、果萨斯片区。乡党委、政府设在柯克亚片区，西合甫片区与莫木克片区距乡政府有40余公里，果萨斯片区距乡政府165公里。