保税港区平均纵深约2.5公里，主要布局码头作业区、保税物流区、保税加工区和管理服务区4个功能区。深水岸线约4.6公里，规划建设集装箱泊位10个(8个10万吨级、2个5万吨级)，设计年吞吐能力640万TEU(折合6400万吨)。2007年，钦州港完成吞吐量1206万吨，增长58.3%。