巩乃斯乡位于和静县西北天山中段林区，距和静县城255公里，东南与额勒再也特乌鲁乡相连，西与新源县接壤，北与尼勒克县、乌苏县、沙弯县毗邻。全乡行政总面积2277平方公里，其中草原面积8.29万公顷，森林面积7.9万公顷。交通便利，国道218线穿越乡境79公里。