木瓜镇位于府谷县中部偏东，距县城23公里，东与清水镇接壤，南与府谷镇、孤山镇毗邻，西与庙沟门镇交界，北与赵武家湾镇为邻。全镇占地面积173.73平方公里，耕地面积59200亩，其中水浇地3800亩，辖15个行政村，101个自然村，2456户，11947人，其中非农业人口249人。