仓山区，因为在盐仓前而得名，仓山古称藤山， 明洪武年间山北麓开始建盐仓，该地俗通称 盐仓前， 藤山遂又通称仓前山， 简称仓山， 区名由此而来。仓山的区建置前隶属于闽侯县，民国36年始建置区，当时区域仅3平方公里。

境内多山丘坡地，面积约占总面积五分之三。地势由西北向东南倾斜，烟台山、长安山、虾蟆山纵贯中部，其中位于西部的虾蟆山海拔72米，为中北部最高海拔。每逢洪水大潮，临江的大部分地区平地可行舟，水患较严重。 区所在地属于典型的河口盆地， 总面积约142平方千米，地表起伏大，丘陵分布在中、西北、东南部，丘陵自北向南依次有翁主山、鬼洞山、妙峰山、高盖山、城门山、清凉山。

境内地质主要由中生代熔岩，燕山期入侵岩及第四纪沉积物构成，受到以断裂为主，褶皱为次的构造变动影响，表现在构造特征上岩层成宽缓的隆起和坳陷，褶皱构造由于受以后的岩浆侵入和喷发作用所破坏，表现不明显。而断裂构造极为发育，主要是由于位于福州山字型构造的前弧和北北西向张扭性断裂、北东东向压扭性断裂的交汇处，受上述断裂构造的控制，断裂发育、动力变质作用强烈。福州山字型构造在境内南部通过，沿乌龙江作弧形分布，控制闽江南港河流形态，并在境内南部造成岩层动力变质带。